Zgodnie ze zmianą w ordynacji podatkowej z 2009 r., kontrola skarbowa zwykle nie jest czynnością niezapowiedzianą. Podatnicy, otrzymują zawiadomienie o wszczęciu kontroli nie później niż 7 dni przed jej rozpoczęciem. Jeśli w ciągu 30 dni od daty doręczenia zawiadomienia kontrola nie rozpocznie się, podatnik musi otrzymać ponowne zawiadomienie. Zawiadomienie informuje między innymi o tym, jakie elementy ewidencji będą sprawdzane, dzięki czemu można się przygotować do kontroli.
Istnieją jednak przypadki, w których wciąż praktykowana jest niezapowiedziana kontrola. Powiadomienie o kontroli nie jest wysyłane, jeżeli dotyczy ona:
zwrotu naliczonego podatku VAT,
nieopodatkowanych przychodów,
działalności gospodarczej, która nie została wcześniej zgłoszona,
postępowania przygotowawczego wszczętego przez organ podejrzewający popełnienie przestępstwa (karnego lub skarbowego),
doraźnego sprawdzenia spisu z natury lub ewidencji kasy fiskalnej.