Mylenie dochodowego z VAT nie jest czymś, ze tak powiem oryginalnym :)
Jak masz wysokie koszty to lepiej zasady ogólne... a co do VAT, o ile to możliwe możesz skorzystać ze zwolnienia lub od początku być na VAT :)
Dochodowy płacimy od swoich dochodów, a VAT to zagadnienie podatku pośredniego, pt... za dużo VATu zapłaciliśmy niż naliczyliśmy naszym klientom, to państwo zwraca i odwrotnie.. za dużo VAT "ściągnęliśmy" z klienta, niż wydatkowaliśmy zakupując towary, śr. trwałe, to oddajemy do budżetu :)