Wg mnie nie, ponieważ tytuł prawny wymagany jest na dzień składania wniosku, a nie dzień poniesienia wydatków. Czyli jeśli w momencie starania się o zwrot różnicy VAT budynek był mieszkalnym, to wszystko było ok. Gdybyście starali się o zwrot kiedy budynek byłby już przekwalifikowany (czyli by już nie był budynkiem mieszkalnym) no to wtedy sprawa wyłudzenia, bo zwrot różnicy VAT jest za materiały zużyte na budynek mieszkalny :)
Skoro można przebudować budynek gospodarczy na mieszkalny i starać się o zwrot VAT, to w odwrotną stronę, jeśli budynek mieszkalny zostanie zmieniony na budynek innej kategorii, to od momentu zmiany wszelkie materiały wykorzystane w nim nie kwalifikują się do starania o zwrot różnicy VAT :)