Biskupi katoliccy w Pakistanie uważają, iż zalecenie uczestniczenia w lekcjach islamu obejmujące chrześcijan, hinduistów oraz Sikhów prowadzi do ograniczenia praw mniejszości wyznaniowych. Niepokój katolików budzi także fakt, iż w szkołach publicznych lekcje poświęcone filozofii oraz społeczeństwu opierać się mają na tekstach wywodzących się wyłącznie z tradycji muzułmańskiej. W przepisach wykonawczych władze oświatowe dopuszczają co prawda możliwość organizacji zajęć alternatywnych dla uczniów nie wyznających islamu, ale ostrzegają, iż uczniowie tacy narażają się na izolację wśród większościowej społeczności szkolnej. Biskupi katolicy w Pakistanie wezwali władze do ponownego przemyślenia instrukcji i zapewnienia wszystkich uczniom swobód obywatelskich gwarantowanych przez konstytucję. Chrześcijanie są w Pakistanie mniejszością, a ich wspólna liczy niecałe trzy miliony wiernych.